\chapter dient hier nur als übergeordnete Themenbezeichnung und \section soll sich in der Abfolge wie \chapter verhalten
\documentclass[a4paper, 12pt]{scrbook} \usepackage[ngerman]{babel} \usepackage[cm-default]{fontspec} \usepackage{xunicode} \usepackage{xltxtra} \usepackage{blindtext} \renewcommand*{\thesection}{\arabic{section}} % Beginn der Zählung und Benummerung erst ab \section \begin{document} \addchap{Thema} \section{Überschrift} \blindtext[1] \section{Überschrift} \blindtext[1] \addchap{Thema} \section{(3) Überschrift} \blindtext[1] \section{(4) Überschrift} \blindtext[1] \end{document}