Zum einen solltest auch du den
Hinweis für Code in Beitrag, der unmittelbar über dem Eingabefeld für eine Nachricht hier im Forum steht beachten.
Dann ist dein Beispiel leider kein
Minimalbeispiel nach Anleitung, weil ausgerechnet die wichtige Literaturdatenbank (bib-Datei) fehlt und wir auch MastersDoctoralThesis.cls nicht haben (ich kann nur vermuten, dass es sich dabei um die Klasse von
http://www.latextemplates.com/templates ... esis_1.zip handelt). So können wir kaum mehr sagen, als dass entweder beim Export der bib-Datei etwas schief läuft oder bei der Umwandlung mit bibtex.
Das führt auch gleich zum nächsten Hinweis: Ich würde dringend empfehlen für ein neues Dokument nicht mehr das veraltete bibtex-System mit bst-Dateien zu verwenden, sondern wie in den
wichtigen Hinweisen empfohlen
biblatex mit
biber einzusetzen.
BTW:
subfigure ist ebenfalls veraltet und sollte für ein neues Dokument durch
subfig oder (das IMHO bessere)
subcaption ersetzt werden.