Neben den von u_fischer schon angesprochenen wichtigen Punkten ist auch
author = {Hallah Ahmad Alyosef, A. Eilert} inkorrekt; es müsste wohl
author = {Hallah Ahmad Alyosef and A. Eilert}, heißen.
Die Angabe von akademischen Titeln und Graden im Literaturverzeichnis ist sehr unüblich, von daher wäre author = {Prof. Dr. Dr. Reinhard E. Geiger}, besser
author = {Reinhard E. Geiger},
Bei
biblatex gehört das Abrufdatum einer URL im YYYY-MM-DD-Format in das urldate-Feld, comment = {Zugriff: 08.01.2016}, wird komplett ignoriert (ebenso wie die Felder timestamp und owner).
Bei A.dissertation fehlen einige Angaben (ein @article hat verpflichten ein jounral(title)), das "Dissertation" im Key lässt mich vermuten, dass es sich gar nicht um einen Artikel in einer Fachzeitschrift handelt, sondern um eine Dissertation, die den Typen @thesis bekommen sollte. Dann wird üblicherweise die Uni (und Ort) mit angegeben.
Bei
Title = {On the function of silica in the nutrition of cereals-PartI},
scheinen gegen Ende ein paar Leerzeichen abhanden gekommen zu sein.
Der Titel das Journals ist denke ich auch eher Journal = {Proceedings of the Royal Society B}, als einfach nur "the Royal Society".
Auch Deine .bbl, die irgendwie nicht ganz zur .bib passt, weist einige Probleme auf.
Einige Male sind ein paar Buchstaben zu viel großgeschrieben "CHem", "PLant". Die Auflage gehört in das Feld edition und nicht number, sie wird dort ohne "Auflage" oder Punkt angegeben: edititon = {95}.
Der Ort des Verlegers wird im Feld location separat angeben und gehört nicht mit ins publisher-Feld.
Zu Deiner Kritik an der Ausgabe:
Die Unterstreichungen kommen (Ulrike erwähnte es oben) von
ulem. Vor der URL steht immer "URL", wenn Du das nicht möchtest, musst Du das mit
\DeclareFieldFormat{url}{\url{#1}} ausschalten.
Auch das "in" kann ausgeschaltet werden:
hier bei TeX.SX.
Die Ausgabe der DOIs kannst Du mit doi=false unterbinden.
Die Autorenreihenfolge sollte den Problemen in Deiner .bib-Datei geschuldet sein.
Deine
biblatex-Version ist übrigens auch schon zwei Jahre alt, ein Update also vielleicht nicht so verkehrt.