Googelein, Forenlese und darauf erfolgte Anpassungsversuche meinerseits brachten bisher nur bedingt Erfolg.
Das Minimal-Beispiel ist nicht gar zu minimal, weil sonst eines der Probleme mangels 2-seitigem Inhaltsverzeichnis nicht auftaucht.
Ist-Zustand:
\documentclass[12pt,halfparskip,bibtotoc,idxtotoc,liststotoc,headinclude,footinclude]{scrartcl}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[ngerman]{babel}
\usepackage[automark]{scrpage2}
\usepackage{geometry}					% Seitenränder <-----------------
\geometry{a4paper, top=35mm, left=40mm, right=25mm, bottom=30mm,
headsep=12mm, footskip=12mm}
\usepackage{tabularx,booktabs,calc,fancybox}
\pagestyle{scrheadings}
\ifoot[]{Autor Name}						% Hier Autorname eintragen! <-----------------
\cfoot{}
\ofoot[]{Seite \pagemark}
\usepackage[activate]{pdfcprot}
\usepackage[babel]{csquotes}
\title{Probleme mit Seitenzahlen sowie Kopf- und Fußzeilen}
\author{Autor Name}						% Hier Autorname eintragen! <-----------------
\begin{document}						% Hier beginnt der Text 
\thispagestyle{empty}					% Diese Seite ohne Kopfzeile <---------------------
Text des Sperrvermerks der Arbeit
\newpage								% Seitenumbruch <-----------------------
\thispagestyle{scrplain}
\pagenumbering{roman}
\setcounter{page}{1}
\tableofcontents
%\thispagestyle{scrplain}
\newpage								% Seitenumbruch <-----------------------
\thispagestyle{scrplain}
\listoftables
\listoffigures
\section*{Anmerkungen} 
\addcontentsline{toc}{section}{Anmerkungen}
Text der Anmerkungen.
\newpage								% Seitenumbruch <-----------------------
\pagenumbering{arabic}
\thispagestyle{scrplain}					% Diese Seite ohne Kopfzeile <---------------------
\section*{Management Summary} 
\addcontentsline{toc}{section}{Management Summary} 	
\newpage								% Seitenumbruch <-----------------------
\section{Eins}
Text
\section{Zwei}
	\subsection{Sub-Eins}
	\subsection{Sub-Zwei}
	\subsection{Sub-Drei}
		\subsubsection{Sub-Sub-Eins}
		\subsubsection{Sub-Sub-Zwei}
		\subsubsection{Sub-Sub-Drei}
Text
\section{Drei}
	\subsection{Sub-Eins}
	\subsection{Sub-Zwei}
	\subsection{Sub-Drei}
		\subsubsection{Sub-Sub-Eins}
		\subsubsection{Sub-Sub-Zwei}
		\subsubsection{Sub-Sub-Drei}
Text
\section{Vier}
	\subsection{Sub-Eins}
	\subsection{Sub-Zwei}
	\subsection{Sub-Drei}
		\subsubsection{Sub-Sub-Eins}
		\subsubsection{Sub-Sub-Zwei}
		\subsubsection{Sub-Sub-Drei}
Text
\section{Fünf}
	\subsection{Sub-Eins}
	\subsection{Sub-Zwei}
	\subsection{Sub-Drei}
		\subsubsection{Sub-Sub-Eins}
		\subsubsection{Sub-Sub-Zwei}
		\subsubsection{Sub-Sub-Drei}
Text
\section{Sechs}
	\subsection{Sub-Eins}
	\subsection{Sub-Zwei}
	\subsection{Sub-Drei}
		\subsubsection{Sub-Sub-Eins}
		\subsubsection{Sub-Sub-Zwei}
		\subsubsection{Sub-Sub-Drei}
Text		
		
\newpage								% Seitenumbruch <-----------------------
Literarurverzeichnis
\newpage								% Seitenumbruch <-----------------------
\appendix
\section{Anhang}
Text
\newpage								% Seitenumbruch <-----------------------
\thispagestyle{empty}
\section*{Ehrenwörtliche Erklärung}
\addcontentsline{toc}{section}{Ehrenwörtliche Erklärung}
\label{sec:ehrenwoertliche-erklaerung}
Hiermit erkläre ich, blablub.
\end{document}
Soll-Zustand:
Sperrvermerk Seite: ok
Inhaltsverzeichnis Seite 1: ok
Inhaltsverzeichnis Seite 2: Kopfzeile ok, Fußzeile nur "ii" (zentriert)
Tabellenverzeichnis Seite: ok
Management Summary Seite: Kopfzeile ok (keine), Fußzeile links "Autor Name", rechts "Seite 1" (Ziffern sollen auch kursiv sein)
restl. Seiten: ok
Besten Dank für Hilfestellungen!


