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\documentclass{scrreprt}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[ansinew]{inputenc}
\usepackage[ngerman]{babel}
\usepackage{ltablex,booktabs}
\usepackage{caption}

\newcommand{\Tabelleninhalt}{ %
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\%
Hier erscheint nun ein etwas längerer Text, der lediglich dazu dient, um die Tabellenspalte aufzublähen. & 2\\
}


\begin{document}
\listoftables

\bigskip

\section{tabularx mittels ltablex}
Im Tabellenverzeichnis erscheint der Eintrag mehrmals, das jeder caption-Aufruf auf Folgeseiten mit eingetragen wird.

\begin{center}
\begin{tabularx}{\textwidth}{X r}
\caption{Eine Überschrift für Tabelle Z}\\
\toprule
Spalte 1 & Spalte 2\\
\midrule
\endfirsthead
\caption{(Fortsetzung)}\\
\toprule
Spalte 1 & Spalte 2\\
\midrule
\endhead
\hline
\multicolumn{2}{r}{\tiny Fortsetzung auf nächster Seite ...}\\
\endfoot
\bottomrule
\endlastfoot
\Tabelleninhalt
\end{tabularx}
\end{center}


\section{longtable mittels ltablex und caption[]}
Bei dem paket longtable funktioniert es, wenn man auf Folgeseiten die Tabellenübschrift mit caption[]\{Eine Tabellenüberschrift\} setzt. Leider hat longtable andere Nachteile.
\begin{center}
\begin{longtable}{l r}
\caption[longtable]{Eine Überschrift für Tabelle Z}\\
\toprule
Spalte 1 & Spalte 2\\
\midrule
\endfirsthead
\caption[]{(Fortsetzung)}\\
\toprule
Spalte 1 & Spalte 2\\
\midrule
\endhead
\hline
\multicolumn{2}{r}{\tiny Fortsetzung auf nächster Seite ...}\\
\endfoot
\bottomrule
\endlastfoot
\Tabelleninhalt
\end{longtable}
\end{center}

\section{tabularx mittels ltablex und caption[]}

Hier kommt es zu Fehlermeldungen, obwohl doch ltablex die Möglichkeiten von tabularx UND longtable bieten soll:
%\begin{center}
%\begin{tabularx}{\textwidth}{X r}
%\caption[tabularx]{Eine Überschrift für Tabelle Z}\\
%\toprule
%Spalte 1 & Spalte 2\\
%\midrule
%\endfirsthead
%\caption[]{(Fortsetzung)}\\
%\toprule
%Spalte 1 & Spalte 2\\
%\midrule
%\endhead
%\hline
%\multicolumn{2}{r}{\tiny Fortsetzung auf nächster Seite ...}\\
%\endfoot
%\bottomrule
%\endlastfoot
%\Tabelleninhalt
%\end{tabularx}
%\end{center}

\end{document}