Entweder du setzt die Tabelle wir Johannes schrieb mit \centering in die Mitte:
\documentclass{scrbook}
\usepackage{caption}
\captionsetup[table]{position=below,skip=2cm}
\begin{document}
\begin{table}
\centering
\begin{tabular}{lll}
1 & 2 & 3 \\
4 & 5 & 6 \\
7 & 8 & 9 \\ \hline
10 & 11 & 12 \\
\end{tabular}
\caption{Zahlen}
\end{table}
\end{document}
oder du deaktivierst die Überprüfung, ob deine Tabellenbeschriftung nur eine Zeile lang ist, so dass diese rechtsbündig gesetzt wird:
\documentclass{scrbook}
\usepackage{caption}
\captionsetup[table]{position=below,skip=2cm,singlelinecheck=off}
\begin{document}
\begin{table}
\begin{tabular}{lll}
1 & 2 & 3 \\
4 & 5 & 6 \\
7 & 8 & 9 \\ \hline
10 & 11 & 12 \\
\end{tabular}
\caption{Zahlen}
\end{table}
\end{document}