AFAIK gibt es derzeit kein Programm, das aus einem PDF (das ist ein Ausgabeformat) ein LaTeX-Dokument (das ist ein Quellformat) macht. Es gibt ein paar Programme, die heuristisch aus einem PDF ein Word-Dokument machen. Ob dabei etwas sinnvolles herauskommt, hängt stark vom PDF ab. Aus Word-Dokumenten kann man dann auch irgendwie ein LaTeX-Dokument machen. Das Ergebnis hängt dann wieder vom Word-Dokument ab. Da die auf diesem Wege generierten Word-Dokumente eher schlecht aufgebaut sind, gilt das dann auch für das LaTeX-Dokument.
Oder willst Du in Wirklichkeit wissen, wie man aus einer LaTeX-Datei eine PDF-Datei macht? Dafür gibt es verschiedene Wege wie pdflatex, xelatex, lualatex, dvipdfmx oder dvips+ps2pdf/pstopdf, um nur einige zu nennen.
Welche Art annotations willst Du? Je nachdem kann die Antwort
hyperref,
bookmark,
mnotes,
pdfcomment oder ähnlich lauten.
Was hat die Frage mit dem Thema LaTeX-Editoren zu tun? Du solltest Dir schon ein wenig Mühe geben, das richtige Unterforum zu treffen.
