Das Beispiel ist keineswegs ein Minimalbeispiel. Es enthält extrem viel, was für das Problem unerheblich ist. Ich erinnere deshalb noch einmal an die erste Zeile meiner Signatur. Dort ist auch ein Link auf eine Anleitung für Minimalbeispiele zu finden.
Das Beispiel ist auch nicht vollständig, da externe Dateien verwendet werden, auf die nicht beigelegt sind. Statt sie beizulegen, sollte man sie aber besser eliminieren. Siehe auch dazu erneut die Minimalbeispiel-Anleitung über ¹ in meiner Signatur.
Du verwendest auch viele Dinge, die man gar nicht verwenden sollte. Siehe dazu l2tabu, das über den ersten Link in der zweiten Zeile meiner Signatur zu erreichen ist. Teilweise werden die Pakete, die Du lädst noch nicht einmal wirklich verwendet. Das gilt beispielsweise für a4wide, das durch die Verwendung von geometry wieder überladen wird, oder ae, das durch die Verwendung von lmodern wieder überladen wird. Du solltest da dringend ausrümpeln.
Desweiteren nutzt Du die Vorteile von LaTeX gar nicht, sondern machst Dinge wie die Paginierung (Seitenzahl) oder den Kolumnentitel (Kapiteleintrag im Kopf) selbst, statt das LaTeX zu überlassen. Wenn Du schon fancyhdr verwendest (in der KOMA-Script-Anleitung wird ausdrücklich empfohlen scrpage2 zu verwenden), dann solltest Du auch dessen Anleitung lesen. Das ganze Gefummel mit \chead, \chapter* und \pagebreak ist unsinnig und führt u. a. auch dazu, dass Du keine Inhaltsverzeichniseinträge hast. Das ist auch in der KOMA-Script-Anleitung³ für \chapter* dokumentiert. Dort ist auch \addchap als Lösung dokumentiert. Dort wird auch erklärt, wie man mit scrpage2 statt fancyhdr und \chead{\headmark} die Kolumnentitel automatisch bekommt.
Bitte lies die Anleitungen (von l2kurz über l2tabu bis scrguide), bevor Du weiter machst. Du wirst sonst nicht glücklich werden. Miste außerdem unbedingt die Präambel aus und lade dort nur die Pakete, die auch wirklich genutzt werden sollen.
Hier einmal ein Beispiel das vermutlich dem, was Du suchst schon sehr nah kommt:
% Es soll offensichtlich mit einem Vorder- und eine Hauptteil gearbeitet
% werden, also scrbook und nicht scrreprt!
\documentclass[headsepline,footsepline,oneside]{scrbook}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[latin1]{inputenc}
\usepackage[ngerman]{babel}% Das Dokument soll offensichtlich in Deutsch
% verfasst werden
% Es wird nur entweder glossaries oder nomencl benötigt. Ich tippe auf
% glossaries:
\usepackage[acronym,toc]{glossaries}\makeglossaries
% Beispieleintrag aus glossariesbegin.pdf
\newglossaryentry{electrolyte}{name=electrolyte,
description={solution able to conduct electric current}}
\usepackage{lmodern}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{amsfonts}
\usepackage{amssymb}
\usepackage[demo]{graphicx}% Option Demo, weil hier hier ein Minimalbeispiel
% haben (siehe ¹)
%Seitenränder festlegen
\usepackage[a4paper, left=4cm, right=2cm, top=2.5cm, bottom=2.5cm]{geometry}
\usepackage[onehalfspacing]{setspace}% statt \linespread{1.5} siehe l2tabu²
\addtokomafont{pageheadfoot}{\linespread{1}\selectfont}% im Kopf wollen wir
% das aber nicht
\AtBeginDocument{% eineinhalbzeilig in den Verzeichnissen ist Unsin!
\addtocontents{toc}{\protect\singlespacing}%
\addtocontents{lof}{\protect\singlespacing}%
\addtocontents{lot}{\protect\singlespacing}%
}
\usepackage[automark]{scrpage2}% für den Seitenstil
% \raisebox wird verwendet, weil das Logo oben aus dem Kopf herausragen darf.
\ohead{\raisebox{0pt}[\ht\strutbox]{\includegraphics[width=2cm,height=2\baselineskip]{Logo2}}}
\ihead{\raisebox{0pt}[\ht\strutbox]{\includegraphics[width=2cm,height=2\baselineskip]{Logo1}}}
\chead{\headmark}% In die Mitte den Kolumnentitel
\pagestyle{scrheadings}
\usepackage{blindtext}% Erzeugt praktischen Beispieltext
\begin{document}
%Deckblatt einfügen (auskommentiert, wiel für das Beispiel unerheblich)
% \includepdf[pages=1]{Deckblatt.pdf}
% Titelblatt
% entweder automatisch:
\title{Testtitle}
\author{Ich}
\begin{singlespace}% eineinhalbzeilig ist im Titel Unsinn!
\maketitle
\end{singlespace}
% oder manuell
%\begin{titlepage}
% \onespacing% eineinhalbzeilig ist im Titel Unsinn!
% \centering
% {\huge\textbf{testtext}\par}% \huge ist ein Umschalter ohne Argument!
%\end{titlepage}
\frontmatter
\chapter{Danksagung}
\blindtext
\chapter{Sperrvermerk}
\blindtext
\chapter{Erklärung}
Ich erkläre ehrenwörtlich
\begin{enumerate}
\item{testtext}
\item{testtext }
\item{testtext}
\end{enumerate}
\begin{tabular}{@{}lp{10em}@{}}
Hier, den \today & \\
\cline{2-2}
& \footnotesize Unterschrift\\
\end{tabular}
\chapter{Vorwort}
\blindtext
%Symbolverzeichnis
\printglossaries
%Inhaltsverzeichnis
\tableofcontents
\mainmatter
\blinddocument
\gls{electrolyte}% nur damit auch ein Glossary-Eintrag verwendet und damit
% im Verzeichnis eingetragen wird
\end{document}
Bitte lies in den genannten Anleitungen, vor allem in der KOMA-Script-Anleitung³ und der glossaries-Anleitung wirklich nach, was ich da gemacht habe!!!
Achja: In der glossaries-Anleitung steht dann auch, dass Du min. einen LaTeX-Lauf, einen makeglossaries-Aufruf und einen weiteren LaTeX-Lauf benötigst, um ein Glossar zu erhalten.