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\usepackage[version=4]{mhchem}

\makeatletter
\@addtoreset{equation}{section}         %Zurücksetzen der Nummerierung je Kapitel
\@addtoreset{figure}{section}
\@addtoreset{table}{section}
\renewcommand{\theequation}{\arabic{section}.\arabic{equation}}
\renewcommand{\thefigure}{\arabic{section}.\arabic{figure}}
\renewcommand{\thetable}{\arabic{section}.\arabic{table}}
\makeatother


\begin{document}

Entsprechende Intermediate ergeben sich auch für Ammoniumfluorid, wobei es in diesem Fall zwei Gleichgewichtsreaktionen (\cref{eq:NH4F1,eq:NH4F2}) gibt, die sich ergänzen.

\begin{equation}
\ce{3NH4+ + 2F- + GaN(s) <=> [Ga(NH3)4F2]+}
\label{eq:NH4F1}
\end{equation}


\begin{equation}
\ce{3NH4+ + 4F- + GaN(s) <=> [Ga(NH3)2F4]- + 2NH3}
\label{eq:NH4F2}
\end{equation}

\end{document}