chemfig: solvatation

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Re: chemfig: solvatation

von tals » Fr 24. Apr 2020, 18:22

Herrje, das hab ich gestern spät gar nicht mehr bedacht, entschuldigt :oops:




\documentclass{article}
\usepackage{chemfig}

\input chemfig.tex
%\usemodule{chemfig}

\usepackage{chemformula}

\usepackage{tikz}
%\usetikzlibrary{Mit Kommata getrennte Liste}

\usepackage{pdflscape}
%\usepackage{lscape}

\usepackage{microtype}% verbesserter Randausgleich

\begin{document}
%\begin{landscape} %Querformat


%octylkette
\definesubmol\octyl{C(-[::150]H)(-[::-45]H)
-[::30,1.5] % 2.0 verdoppelt Strichlänge % 30° in C-Kette
C(-[::30]H)(-[::120]H)
-[::-30,1.5]C(-[::-120]H)(-[::-30]H)
-[::30,1.5]C(-[::30]H)(-[::120]H)
-[::-30,1.5]C(-[::-120]H)(-[::-30]H)
-[::30,1.5]C(-[::30]H)(-[::120]H)
-[::-30,1.5]C(-[::-120]H)(-[::-30]H)
-[::30,1.5]C(-[::30]H)(-[::120]H)(-[::-30]H)
}


%TOA-Kurzbefehl

\definesubmol\toaplus{
H(-[::-90] %90° Drehung bis zum N
\phantom{N^+}
([,0.75] %verkürzt alle H-Bindungen danach (warum auch immer)
%N^+
%\smash{
\charge{15:2.0pt=$\scriptstyle+$}{N}%N-Ladung
%\phantom{N^+}
(-[::-160,2.0]!\octyl) % linke Kette
(-[::-90,2.0]!\octyl) % mittlere Kette
(-[::-30,2.0]!\octyl) % rechte kette
))}



%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%2:1 Salz (so4 regulär - toa / toa )

\scalebox{0.5}{
%\begin{figure}[htb!] %auf Seite zentrieren
\centering
%\tiny %Verkleinerung
\chemfig{
%SO4
\charge{20:1.5pt=$\scriptstyle-$}{O}
\vphantom{O^-}
% TOA links
(-[:-120, 1.5,,, pink, dash pattern=on 2pt off 2pt] %charakterisiert Bindung
\hphantom{H}
([:-30]!\toaplus)) % dreht TOA
-[:90]S
(=[::90]O)
(-\charge{45:1.5pt=$\scriptstyle-$}{O}
\phantom{O}
% TOA rechts
(-[:30, 1.5,,, pink, dash pattern=on 2pt off 2pt] %charakterisiert Bindung
\hphantom{H}
([:120]!\toaplus)) ) % dreht TOA
=[:90]O
}
%\end{figure}
}


%%%%%%
%Octanol
%Octanol
\chemfig{C(-[::-135]H)(-[::-45]H)(-[::135]H)
-[::30,2.0] % 2.0 verdoppelt Strichlänge % 30° in C-Kette
C(-[::30]H)(-[::120]H)
-[::-30,2.0]C(-[::-120]H)(-[::-30]H)
-[::30,2.0]C(-[::30]H)(-[::120]H)
-[::-30,2.0]C(-[::-120]H)(-[::-30]H)
-[::30,2.0]C(-[::30]H)(-[::120]H)
-[::-30,2.0]C(-[::-120]H)(-[::-30]H)
-[::30,2.0]C(-[::30]H)(-[::120]H)
-[::-60]O-[::60]H }



%\end{landscape} %Querformat Ende

\end{document}

Re: chemfig: solvatation

von markusv » Fr 24. Apr 2020, 06:51

Wir sind keine Chemiker, d.h. der Großteil der Leser wird nicht wissen, wie die "Solvatation eines Aminsalzes durch Octanol" aussieht. Daher werden dir auch die Wenigsten helfen können.

Gibt es ein Minimalbeispiel oder wenigstens eine Zeichnung/Abbildung, wie das Ganze am Ende aussehen soll?

chemfig: solvatation

von tals » Fr 24. Apr 2020, 00:29

Guten Abend zusammen,

ich würde gerne die Solvatation eines Aminsalzes durch Octanol mit chemfig darstellen. Sprich: Ausrichtung der Octanolmoleküle am Salz und verbunden mit entsprechenden zahlreichen H-Brücken.
(Das Salz habe ich mit \definsubmole AminMolekülen gebaut)

Hiermit suche ich keine Komplettlösung, sondern nur Ideenansätze, wie man das "klug" lösen könnte, bevor ich Tagelang an einer Stümperlösung bastle, die dann nichtmal richtig funktioniert....

(Eine bisherige Überlegung wäre zB Octanol durch unsichtbare Bindungen zu positionieren und dann die H-Brücken mit ? Ankern zu setzen)

Für jede kreative Idee bin ich dankbar =]

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