Hallo Johannes,
vielen Dank für deine Antwort.
Der Grund für IEEEeqnarray war, das ich manchmal 2 Gleichungen in einer Umgebung untereinander habe, wobei zusätzlich die erste für eine Zeile zu lang ist und deswegen umgebrochen werden muss.
Dann hatte ich die "the not so short introduction to latex" bei der hand und dort wird ja die IEEEeqnarray-Umgebung empfohlen und so kam es.
Nun hab ich mich aber gestern Abend nochmal in Ruhe damit beschäftigt und einen guten Alternativweg mit align und split gefunden. Durch Verwendung der Option "tbtags" bei AMSMATH kann man (,wie ich es gerne hätte) die Gleichungsnummerierung in der split-Umgebung in der letzten Zeile positionieren.
Zudem wird das "+"-Zeichen in der zweiten Zeile der ersten Gleichung besser positioniert.
Hier ein Lösungsvorschlag:
\documentclass[12pt,a4paper]{scrreprt}
\usepackage[latin9]{inputenc}
\usepackage[tbtags]{amsmath} %Tag-Positionierung oben bzw. unten in Split-Umgebung
\usepackage{amsfonts}
\usepackage{amssymb}
\usepackage{cleveref}
\usepackage[retainorgcmds]{IEEEtrantools}
\begin{document}
\chapter{Test 1}
\section{Test 2}
Wie man in \cref{eq:test} sieht ist $a^2+b^2=c^2$.
\begin{IEEEeqnarray}{rCl}
a+b &=& c+d+e+g+r+g+r+e+d \nonumber \\
&& + \: g+w+q+r+a+s+c \\
a^2 + b^2 &=& c^2
\label{eq:test}
\end{IEEEeqnarray}
Hier das ganze mit align-Umgebung und man sieht das ebenfalls \cref{eq:test2} $c^2$ ergibt.
\begin{align}
\begin{split}
a+b &= c+d+e+g+r+g+r+e+d \\
& \quad +g+w+q+r+a+s+c
\end{split}\\
a^2 + b^2 &= c^2
\label{eq:test2}
\end{align}
\end{document
MfG