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Mach ein [url=http://texwelt.de/wissen/fragen/569/was-ist-ein-vollstandiges-minimalbeispiel-oder-kurz-vm-und-wie-erstelle-ich-dieses]VM (mit Anleitung zur Erstellung nicht nur für Anfänger)[/url], mit dem man das Problem reproduzieren kann, und korrigiere bei der Gelegenheit auch gleich die Formatierung Deines Beitrags.

 % 
\documentclass{scrreprt}
\usepackage[ngerman]{babel}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{geometry}
\geometry{top=2cm, bottom=3cm}
\usepackage{scrpage2}
\automark[chapter]{section}
\pagestyle{scrheadings}
\clearscrheadfoot
\ohead{\leftmark}
\ofoot[\pagemark]{\pagemark}
\begin{document} 

\include{./Titelseite/Titelseite}
\include{./Seite2/Seite2}
\tableofcontents

\include{./Einleitung/Einleitung}
\include{./Material/Material}
\include{./Ergebnisse/Ergebnisse}
\include{./Diskussion/Diskussion}
\include{./Zusammenfassung/Zusammenfassung}
\include{./Literaturverzeichnis/Literaturverzeichnis}
\end{document}

[code] %
\documentclass{scrreprt}
\usepackage[ngerman]{babel}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{geometry}
\geometry{top=2cm, bottom=3cm}
\usepackage{scrpage2}
\automark[chapter]{section}
\pagestyle{scrheadings}
\clearscrheadfoot
\ohead{\leftmark}
\ofoot[\pagemark]{\pagemark}
\begin{document}

\include{./Titelseite/Titelseite}
\include{./Seite2/Seite2}
\tableofcontents

\include{./Einleitung/Einleitung}
\include{./Material/Material}
\include{./Ergebnisse/Ergebnisse}
\include{./Diskussion/Diskussion}
\include{./Zusammenfassung/Zusammenfassung}
\include{./Literaturverzeichnis/Literaturverzeichnis}
\end{document}[/code]

Ich hätte gerne als Kopfzeile jeweils den Kapitelnamen und in der Fußzeile die Seitenzahl. Leider ist momentan die Kopfzeile leer.

Vielen Dank im Voraus für die Hilfe!