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Code: 

\documentclass[ twoside=false,headsepline,plainheadsepline]{scrbook} 
\usepackage[latin1]{inputenc} 
\usepackage[T1]{fontenc} 
\usepackage[ngerman]{babel} 

\usepackage[automark]{scrpage2} 
\clearscrheadfoot % löscht bisherigen Kopf- und Fußzeileninhalt
\ofoot[\pagemark]{\pagemark} 
\ohead{\headmark} 
\pagestyle{scrheadings} 

\usepackage{blindtext} 

\begin{document} 
\Blinddocument\Blinddocument 
\end{document} 

\input{config/preamble}
\input{config/docspecific}
\input{config/macros}
%hier habe ich für Seitenzahlen und Kapitelhinweis der Kopfzeile eingefügt:
\usepackage{scrpage2}
\pagestyle{scrheadings}
\ihead[]{}                                  %Kopfzeile Links
\chead[]{}                %Kopfzeile Mitte
\ohead[]{\headmark}       %Kopfzeile Rechts
\ifoot[]{}                %Fußzeile Links
\cfoot[]{}                %Fußzeile Mitte
\ofoot[\pagemark]{\pagemark}    %Fußzeile Rechts

\begin{document}
% daraufhin habe ich ab der Seite nach Titelblatt, Aufgabenstellung, Eidesttattlicher Erklärung, ab der Seite wo, der Kapitelhinweis beginnen soll eingefügt:
\pagestyle{scrheadings}

\end{document

headsepline=true,       % Header mit Linie abtrennen

\documentclass[ twoside=false,headsepline]{scrbook} 
\usepackage[latin1]{inputenc} 
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[ngerman]{babel}

\usepackage[automark]{scrpage2}
\clearscrheadfoot
\ofoot[\pagemark]{\pagemark}
\ohead{\headmark}
\pagestyle{scrheadings}

\usepackage{blindtext}

\begin{document}
\Blinddocument\Blinddocument
\end{document}

\documentclass[%
    paper=A4,               % Papierformat
    twoside=false,         	% einseitig bedruckt
    fontsize=12pt,          % Schriftgröße
    titlepage=true,         % Titelseite
    listof=totoc,           % Tabellen-/Abb.verzeichnis ins Inhaltsverzeichnis
    bibliography=totoc,     % Literaturverzeichnis ins Inhaltsverzeichnis
    listof=flat,            % Tabellen-/Abb.verzeichnis ohne Einzug
    headsepline=true,       % Header mit Linie abtrennen
    footsepline=false,      % Footer nicht mit Linie abtrennen
    captions=tableheading,	% Abstände anpassen, für Captions oberhalb von Tab.
    numbers=noendperiod,    % keine Punkte am Ende von Kapitel-/Anhangnummern
    parskip=half-,          % halber Zeilenabstand zwischen Absätzen
    headings=normal         % Überschriften "normaler" Größe
]{scrbook}	
\usepackage{scrhack}
\usepackage{lmodern}
\usepackage[latin1]{inputenc}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage[a4paper]{geometry}
\ifprint % Druck: Ränder Doppelseite im Verhältnis 1:1:1, mit Bindekorrektur
  \geometry{%
    includehead=true, % wg. fancyhdr-Formatierung zählt Head optisch zum Text
    hmarginratio=1:2, % Rand innen:außen (für Doppelseite ergibt sich: 1:1:1)
    vmarginratio=3:5, % Rand oben:unten (Standard: typearea 1:2, geometry 2:3)
    textwidth=170mm,  % Breite der Textfläche (ohne Randnotizen)
    textheight=230mm, % Höhe der Textfläche (ohne Header)
    headheight=20pt,  % Header größer gegen overfull vboxes (Standard: 12pt)
    footskip=15mm,    % Abstand Baseline des Footer zum Textkörper
    bindingoffset=6mm % Bindekorrektur BCOR
  }%
\else % Digital: horizontal zentriert, ohne Bindekorrektur
  \geometry{%
    includehead=true, % wg. fancyhdr-Formatierung zählt Head optisch zum Text
    hmarginratio=1:1, % Rand innen:außen (PDF: Textkörper zentrieren!)
    vmarginratio=3:5, % Rand oben:unten (Standard: typearea 1:2, geometry 2:3)
    textwidth=170mm,  % Breite der Textfläche (ohne Randnotizen)
    textheight=230mm, % Höhe der Textfläche (ohne Header)
    headheight=20pt,  % Header größer gegen overfull vboxes (Standard: 12pt)
    footskip=15mm,    % Abstand Baseline des Footer zum Textkörper
    bindingoffset=0mm % Bindekorrektur BCOR
  }%
\fi
\usepackage{setspace}
\widowpenalty=10000
\clubpenalty=10000
\displaywidowpenalty=10000
\tolerance 1414
\emergencystretch 1.5em
\hbadness 1414
\hfuzz 0.3pt
\vfuzz 0.3pt
\raggedbottom
\setcounter{secnumdepth}{2} % subsection
\setcounter{tocdepth}{2} % subsection
\newcommand{\dottedsection}[1]{#1.} 

\makeatletter
\renewcommand\paragraph{%
\@startsection%
  {paragraph}%
  {4}%
  {\z@}%
  {3.25ex \@plus1ex \@minus.2ex}%
  {-1em}%
  {\raggedsection\normalfont\sectfont\nobreak\size@paragraph\dottedsection}%
}
\makeatother
\makeatletter
\newcommand{\saved@chapter}{}
\let\saved@chapter\chapter

\newcommand*{\my@chapter}[2][]{%
  \bookmarksetup{bold=true}%
  \saved@chapter[#1]{#2}%
  \bookmarksetup{bold=false}%
}

\renewcommand{\chapter}{%
  \@ifstar{\saved@chapter*}{\@dblarg\my@chapter}%
}
\makeatother
\renewcommand*{\chapterheadstartvskip}{%
\vspace*{\baselineskip} % KOMA-Script-Standard: 2.3\baselineskip
}
\usepackage[sumlimits,intlimits]{amsmath}
\usepackage{bm}
\usepackage[ngerman]{babel}
\usepackage{ngerman}
\usepackage{ragged2e}
\usepackage{sistyle}    % Abstand und Nummernformatierung
\usepackage{calc}
\usepackage{multirow}
\usepackage{tabularx}
\usepackage{booktabs}
\usepackage[neverdecrease]{paralist}
\setcounter{topnumber}{3}     % Standard: 2
\setcounter{bottomnumber}{2}  % Standard: 1
\setcounter{totalnumber}{4}   % Standard: 3
\renewcommand{\floatpagefraction}{0.7}  % Standard: 0.5
\renewcommand{\textfraction}{0.1} 
\renewcommand{\topfraction}{0.9} 
\renewcommand{\bottomfraction}{0.7} 
\makeatletter
\renewcommand{\fps@figure}{htbp}%
\renewcommand{\fps@table}{htbp}%
\makeatother
\usepackage{float}
\usepackage{xcolor}
\usepackage{graphicx}
\usepackage[update]{epstopdf}
\usepackage[figuresright]{rotating}
\usepackage{subfig}
\usepackage{caption}[2007/04/09]
\captionsetup{                  % globale Option für caption und subcaption
  font=normalsize,              % Schrift der Caption (Label+Text)
  format=hang,                  % Formatierung der Caption
  justification=RaggedRight,    % linksbündig bei mehreren caption-Zeilen
  singlelinecheck=true,         % true: einzelne Linie zentriert!
  labelfont=bf,                 % Schrift des Labels
  textfont=rm,                  % Schrift des Textes
  position=bottom               % Normale Caption unter dem Float
}
\DeclareCaptionLabelFormat{Klammer}{#2)}
\usepackage{hyperref}

\hypersetup{%
  %hyperfootnotes=true,         % footnote verlinken zum footnotetext
  plainpages=false,             % true > Erzwingt arabische (1,2,...) Zahlen
  linktocpage=false,            % Seitenzahlen im Inhaltsverz. verlinkt
  unicode,                      % Unicode-Zeichen in Bookmarks, s.u.
  breaklinks=true               % Umbrüche in Links erlaubt
}

\ifprint % Druckversion
  \hypersetup{%
    colorlinks=false,            % Links werden umrandet dargestellt
    pdfborder=0 0 0,             % Umrandung wird deaktiviert
    pdfpagelayout=OneColumn		 % Doppelseite, ungerade Seiten rechts
  }

\else % Digitalversion
  \hypersetup{%
    colorlinks=true,             % Links werden farblich dargestellt
    linkcolor=seclinks,          % "normal internal links" > Farbdefinition s.o.
    citecolor=citelinks,         % "bibliographical cites" > Farbdefinition s.o.
    urlcolor=urllinks,           % URLs > Farbdefinition s.o.
    pdfpagelayout=OneColumn      % eine Seite, kontinuierliches Scrollen
  }
\fi
\usepackage{url}
\usepackage{bookmark}
\bookmarksetup{%
  open=true,        % Bookmark-Baumstruktur ausgeklappt
  openlevel=1,      % Anzahl der Ebenen, die ausgeklappt werden
  numbered=true     % Nummerierung d. Bookmarks mit Nummern
}
\usepackage[all]{hypcap}
\renewcommand{\hypcapspace}{\baselineskip}
\usepackage{pdfpages}
\usepackage{listings}
\usepackage{ifthen}
\usepackage{varwidth}
\usepackage{xspace}
\numberwithin{equation}{chapter}
\numberwithin{figure}{chapter}
\numberwithin{table}{chapter}